De grootste kennisbank van het HBO

Inspiratie op jouw vakgebied

Vrij toegankelijk

Terug naar zoekresultatenDeel deze publicatie

Breukpuntanalyse bij NF1 patiënten

Rechten: Alle rechten voorbehouden

Breukpuntanalyse bij NF1 patiënten

Rechten: Alle rechten voorbehouden

Samenvatting

Samenvatting
Tijdens de afstudeerperiode heb ik de breukpunten in het NF1 gen bij patiënten met neurofibromatose
type 1 (NF1) onderzocht, nadat met behulp van MLPA analyse een afwijkend patroon was aangetoond.
Hieruit bleek dan of er bepaalde exonen of het gehele gen gedeleteerd of gedupliceerd waren. Bij de
families waarbij de MLPA een deletie van exon 1 (het eerste exon) of exon 49 (het laatste exon) of het
gehele gen liet zien, werd eerst Q-PCR analyse toegepast om het deletiegebied te definiëren voor exon
1 en na exon 49. Indien de grenzen van de deletie bepaald zijn, werden Oligo primers gezocht, voor
Long-template PCR, om over het breukpunt heen te amplificeren. In dit verslag behandel ik twee
families met elk een andere mutatie. In familie 29403, waar een deletie exon 1 gevonden werd met de
MLPA analyse, werd Q-PCR uitgevoerd. Hierbij is het zoekgebied naar de breukpunten verkleind en ligt
het eerste breukpunt op minder dan 7 kb voor exon 1 van het NF1 gen. Bij familie 25338, waarbij het
MLPA patroon een deletie van exon 4A weergaf, werden de breukpunten gevonden; deze mutatie werd
vervolgens omschreven als c.289-1434_479+4079 del5704ins55. Vervolgens is er ook een mutatie
specifieke test voor deze familie opgesteld. Hiermee kunnen andere leden van de familie in één test
geanalyseerd worden op deze mutatie.

Summary
During my graduation I investigated breakpoints in the NF1 gene on patients diagnosed with
Neurofibromatosis type 1 (NF1), after a changed patern was found in the MLPA analysis.

With this test could be proven that there was a deletion of some exons or a deletion of the entire
gene. The cases that showed a deletion of exon 1 (the first exon), exon 49 (the last exon), or the
entire gene, were first analysed with Q-PCR to define the deletion area for exon 1 or after exon 49. If
the boundaries of the deletion were found, Oligo primers were designed for Long-template PCR to
amplify over the breakpoint. Two families with different mutations, found in the MLPA test, are
reviewed in this assay. Q-PCR was carried out on family 29403, were the MLPA showed a deletion of
exon 1. The results of the Q-PCR showed that the breakpoints were closer than 7kb to exon 1. In the
other family (family 25338) the breakpoints were found and the mutation was defined as: c.289-
1434_479+4079del 5704ins 55. A mutation specific test was designed for this family. With this test
other members of the family could be tested on this mutation with one single test.

Toon meer
OrganisatieAvans Hogeschool
PartnersErasmus MC (DNA-diagnostiek, afdeling Klinische Genetica), Rotterdam
Jaar2007
TypeBachelor
TaalNederlands

Op de HBO Kennisbank vind je publicaties van 26 hogescholen

De grootste kennisbank van het HBO

Inspiratie op jouw vakgebied

Vrij toegankelijk