De grootste kennisbank van het HBO

Inspiratie op jouw vakgebied

Vrij toegankelijk

Terug naar zoekresultatenDeel deze publicatie

Comparison of serotyping and genotyping of HPeV based on both 5’UTR and VP1

Open access

Rechten:Alle rechten voorbehouden

Comparison of serotyping and genotyping of HPeV based on both 5’UTR and VP1

Open access

Rechten:Alle rechten voorbehouden

Samenvatting

Humaan Parechovirussen (HPeV’s), leden van de Picornaviridae familie, zijn geclassificeerd in 5 bekende serotypen; HPeV-1 tot en met 5. HPeV-1 en HPeV-2 infecties zijn het meest geassocieerd met milde respiratoire of gastro-intestinale symptomen, maar ook met ernstige ziektebeelden, zoals paralyse en encefalitis. HPeV-3 infecties worden geassocieerd met voorbijgaande paralyse en neonatale sepsis. HPeV-4 en HPeV-5 worden tot nu toe alleen geassocieerd met hoge koorts.
HPeV’s zijn veelvoorkomende pathogenen die vergeleken met andere virussen weinig bestudeerd zijn en weinig bekend is over de prevalentie van deze virussen. Het typeren van virusisolaten uit faeces monsters van jonge kinderen heeft het mogelijk gemaakt een vergelijking te maken van welke typen het meest voorkomen in welke periode.
Faeces monsters van jonge kinderen van 2004-2006 zijn verzameld en gescreend voor een HPeV (n= 1824) en EV infectie (n= 1834) door gebruik te maken van een HPeV en EV specifieke real time RT-PCR gebaseerd op het 5’UTR. Faeces monsters positief voor een HPeV infectie zijn gegenotypeerd door het VP1 en het geconserveerde 5’UTR gebied te sequensen. Sequenties zijn fylogenetisch geanalyseerd en resultaten van de beide gebieden zijn met elkaar vergeleken.
Faeces monsters met een bekend VP1 en 5’UTR sequentie in 2006 zijn geserotypeerd met een nieuw opgezet neutralisatietest en de resultaten zijn vergeleken met de genotyperings resultaten.
In 2004 was16,3% (92/566) van de verkregen faeces monsters positief voor HPeV, in 2005 was 11,7% van de faeces monsters(70/597) positief voor HPeV en in 2006 was 16,3% van de faeces monsters (108/661) positief voor HPeV. Dit vergeleken met EV was in 2004 16,4% (93/566) van de faeces monsters positief voor EV, in 2005 was 11,8% (71/604) van de faeces monsters positief voor EV en in 2006 was 15,8% (105/664) van de faeces monsters positief voor HPeV.
In totaal konden er 59 HPeV positieve isolaten van 2004 tot en met 2006 getypeerd worden door middel van genotypering op basis van VP1. Hierbij ging het veelal om HPeV-1 of HPeV-3 en er was 1 faeces monster positief voor HPeV-4. Genotypering op basis van 5’UTR genotypering geeft dezelfde genotypes als genotypering op basis van VP1.
Tien HPeV positieve isolaten van 2006 konden geserotypeerd worden als HPeV-1.
In deze studie kunnen we een grote overeenkomst zien met het genotyperen op VP1 gebied en het geconserveerde 5’UTR gebied. Ook zien we een correlatie tussen VP1 genotypering en serotypering.

Afkortingen: HPeV: Human Parechovirus, PCR: Polymerase Chain Reaction, UTR: Untranslated region, VP: Viral capsid Protein.

Toon meer
OrganisatieHogeschool Utrecht
OpleidingBiologie en Medisch Laboratorium Onderzoek
AfdelingLife Sciences en Chemistry
Jaar2007
TypeBachelor
TaalNederlands

Op de HBO Kennisbank vind je publicaties van 26 hogescholen

De grootste kennisbank van het HBO

Inspiratie op jouw vakgebied

Vrij toegankelijk