The scientific literature represents a rich source for retrieval of knowledge on associations between biomedical concepts such as genes, diseases and cellular processes. A commonly used method to establish relationships between biomedical concepts from literature is co-occurrence. Apart from its use …

Phylogenetic patterns show the presence or absence of certain genes in a set of full genomes derived from different species. They can also be used to determine sets of genes that occur only in certain evolutionary branches. Previously, we presented a database named PhyloPat which allows the complete …

In het kader van 'capacity management' beschrijft dit verslag het onderzoek naar gegevens die nodig zijn om rapportages te kunnen maken die inzicht geven over de groeiontwikkeling van data op centrale data-opslag systemen (SAN). Daarnaast is er een detailontwerp uitgewerkt voor de ontwikkeling van een …

In het begin van elk jaar geeft Harvard Business Review aan welke ideeën naar haar mening in dat jaar gaan doorbreken. Drie van de twintig heb ik er eens voor u uitgepakt. Dat zijn de cybercrimeservice-economie, de happy metadata trails en het effect van de blackberry.

Several models in data analysis are estimated by minimizing the objective function defined as the residual sum of squares between the model and the data. A necessary and sufficient condition for the existence of a least squares estimator is that the objective function attains its infimum at a unique …

De behoefte om informatie te ordenen zodat ze 'beheersbaar' wordt, resulteert vaak in een top-down aanpak zoals bibliotheeksystemen die kennen. Betrekkelijk nieuw is de bottom-up aanpak, metadatering gebaseerd op het sociale aspect van consensus. Sybilla Poortman en Gerard Bierens zoomen in op de achtergronden …

The analysis of regulatory regions in genome sequences is strongly based on the detection of potential transcription factor binding sites. The preferred models for representation of transcription factor binding specificity have been termed position-specific scoring matrices. JASPAR is an open-access …